PÖFF Shortsi põhiprogramm koosneb neljast võistlusest.
Rahvusvaheliste žüriide poolt välja valitud parim lühifilm, parim animafilm ja parim Eesti film saavad nominatsiooniõiguse lühifilmi Oscarile, kui need vastavad Ameerika Filmiakadeemia nõuetele. Ühtlasi valitakse võistlevate filmide hulgast välja nominent Euroopa Filmiakadeemia parima lühifilmi auhinnale.
Rahvusvaheline lühifilmivõistlus
Rahvusvaheline animavõistlus
Rahvuslik võistlus
Põhjusega mässajad
PÖFF Shortsi auhinnakujud on loonud kunstnik Eeva Käsper.